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硼在番茄植株中的含量約為5-36mg/kg，含量雖低，但卻是番茄生長必不可缺的營養元素之一，供應不足會對番茄生長造成一系列生理障礙，避免硼缺乏是番茄優質高效栽培的重要基礎。
硼可以增加番茄花粉量并提高花粉萌發能力，為順利完成授粉過程奠定基礎，確保子房正常發育成果實；硼還可以加快葉綠素生成，并提升葉綠體結構的穩定性，從而使光合作用過程得以高效進行。
硼元素能通過增加細胞膜原生質的粘度來提高對水分的保持和吸收能力，從而增加番茄對干旱缺水環境的適應性；而且可以通過抑制吲哚乙酸氧化酶的作用，來提高生長素的活性，從而加快細胞分裂和伸長。
1、根與莖
番茄根尖、莖尖萎縮停止發育，變褐變黑甚至枯死；番茄莖部短縮粗大、扭曲變脆易折斷；易發生縱向開裂，莖部中空，番茄龍頭附近大量生發側枝且生長旺盛。
2、葉
新葉停止發育，出現失綠黃化和萎蔫；老葉顏色濃綠，葉脈葉柄變脆發硬，生長點附近葉片出現畸形，葉色呈褐色或黑色，且越靠近心部越嚴重，后期生長點焦枯。
3、花、果
花粉產生量少，花絲花藥易枯萎，花粉落到柱頭上后萌發困難，導致授粉受精不良，造成落花落果、形成畸形果，甚至果實開裂并在表皮出現木栓化
1、土壤性質不適宜
砂質土壤中的有水溶態硼肥容易隨水被淋失到深層土壤，導致番茄根系吸收不到而變為無效態；黏性土壤中硼活性較低，容易被土壤膠體粘附固定，難以被番茄根系吸收利用。土壤pH值在4.7-6.7范圍內是時，硼肥的水溶性最好，但在這一酸性條件下，水溶態硼肥更容易因降雨或淹水而淋失；在堿性狀態下，硼元素的有效性則隨著pH值的升高而降低。
2、離子拮抗
土壤中氮、鉀、鈣、鎂等離子過多時，會與水溶態硼肥形成拮抗，由于水溶態硼肥含量遠小于以上幾種離子，因此在拮抗競爭中處于劣勢，從而造成硼吸收不良。
3、有機質含量不足
有機質含量高低與土壤中硼元素的有效含量成正比，有機質含量不足時水溶態硼肥更容易被淋失。
1、施足底肥
每茬番茄用硼砂0.5-1.5kg做底肥，為增加硼砂有效性，建議在有機肥堆漚過程中，將硼砂粉碎后摻混到有機肥發酵堆，這樣在發酵過程中可以將硼以有效態形式更充分的釋放到有機肥里面，并被以有效態形式被蓄存在有機肥里面。
2、增加土壤有機質
不論是酸性或堿性土壤還是砂性或黏性土壤，增加土壤有機質都是防止土壤中水溶態硼肥淋失或被吸附固定變為無效態的重要措施，而且有機質在經過腐熟分解后也可以增加土壤中有效態硼的含量。
3、葉片噴施
番茄在進入始花期后對硼的需求量逐漸增大，為防止硼缺乏可在番茄現蕾期每10天左右葉面噴施一次螯合態硼肥，缺硼癥狀比較明顯時可每3-4天噴施一次。
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